这几天西安的疫情终于要过去了,这波由德尔塔引发的疫情让1300万西安人民认识到新冠变种病毒的威力,但是在国内一波未平一波又起,天津、河南等地疫情又出现反复,并且这次是令人色变的奥密克戎变种。那么奥密克戎到底有多厉害,2022年1月10日,美国单日新增感染人数135万[1],是自新冠病毒全球爆发以来,单个国家单日最高数据。现在奥密克戎变种已经取代德尔塔成为新冠世界的霸主!相比德尔塔变异株,奥密克戎是个啥,有什么特点呢?
奥密克戎出现以来美国单日新增感染人数,红线为7日新增均值
2021年11月,奥密克戎在博茨瓦纳首次发现,随后传入邻国南非,并造成局部流行。到2021年12月,奥密克戎成为美国最主要的流行毒株。这个在刺突蛋白上有30多个基因变异的变异株相比较其他变异株,复制能力更强,会免疫逃逸,病症也较轻,但是这一点还要进一步确认。
新冠病毒颗粒,红色为刺突蛋白
更强的复制能力——相比德尔塔,奥密克戎变异株的自我复制能力更强[2]。根据英国卫生安全局的数据,奥密克戎变异株首次在英国发现时德尔塔变异株正在大流行,但是随后奥密克戎的感染数据比德尔塔的感染数据要多得多[3],并且奥密克戎比德尔塔更容易引起家庭内的二次传染(奥密克戎为19%,德尔塔为8%)。不过根据现有少量的体外试验数据,奥密克戎更容易在鼻粘膜上皮细胞和支气管复制,这也造成了奥密克戎比德尔塔更强的传染性[4,5]。奥密克戎之所以复制能力比德尔塔强是因为它有免疫逃逸现象发生。
奥密克戎刺突变异
免疫逃逸——奥密克戎似乎能够躲过人体的体液免疫(奥密克戎变异株病毒进入人体后,在往细胞内钻的这段时间里,能躲过各种免疫细胞的追杀),所以对于先前感染过其他变异株的康复者来说,再次感染奥密克戎的风险较高。在南非的调查报告中,奥密克戎的复感比率为25%,比贝塔变异株复感率12%和德尔塔变异株的9%都要高[6]。免疫逃逸最大影响是对疫苗有效性提出了极大的挑战。早期数据也表明,疫苗在对抗奥密克戎感染方面不如对抗德尔塔病毒有效,但是加强针仍然可以维持对新冠重症的保护作用。
致病严重性——数据表明奥密克戎致病的严重程度不及其他变异株[7,8]。英国的数据表明,感染奥密克戎后入院率大约只有德尔塔的1/3[9],动物试验也表明与其他变异株比较,感染奥密克戎后,肺部组织内病毒载量较低,临床症状也较轻(仅有体重减轻等症状)[10,11]。不过这并不意味着可以掉以轻心,奥密克戎超高的感染率仍然可能导致入院数激增,造成医疗资源挤兑现象。
影响临床诊断——奥密克戎病毒与其他病毒的一个区别是某些刺突蛋白缺失,这是由于其S基因发生变异,对于检测靶标为S基因的核酸检测试剂可能就无法有效检出奥密克戎变异株,存在假阴性的现象[12]。不过对于我国来说,其突变位点不影响主流核酸检测试剂的敏感性和特异性[13]。
奥密克戎刺突基因序列变异位点
面对德尔塔毒株也好,奥密克戎毒株也罢,不管它是啥样的妖魔鬼怪,只要做到老生常谈的“三板斧”,早晚都能绝对的克敌制胜。这“三板斧”就是:
• 控制传染源:隔离患者、消毒环境等;
• 切断传播途径:维持社交距离、少聚集、戴口罩、勤洗手、注意通风等;
• 保护易感人群:适时接种疫苗,普及加强针等。
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参考文献:
[1]https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#trends_dailydeaths
[2] World Health Organization. Enhancing Readiness for Omicron (B.1.1.529): Technical Brief and Priority Actions for Member States. December 10, 2021.
[3] SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England. Technical briefing 31. December 10, 2021.
[4] Peacock RP, Brown JC, Zhou J, et al. The SARS-CoV-2 variant, Omicron, shows rapid replication in human primary nasal epithelial cultures and efficiently uses the endosomal route of entry. UNPUBLISHED.
[5] HKUMed finds Omicron SARS-CoV-2 can infect faster and better than Delta in human bronchus but with less severe infection in lung. PRESS RELEASE.
[6] Pulliam JRC, van Schalkwyk C, Govender N, et al. Increased risk of SARS-CoV-2 reinfection associated with emergence of the Omicron variant in South Africa 2021-12-01. UNPUBLISHED.
[7] Sheward DJ , Kim C, Pankow A, et al. Quantification of the neutralization resistance of the Omicron Variant of Concern. UNPUBLISHED.
[8] Schmidt F, Muecksch F, Weisblum Y, et al. Plasma neutralization properties of the SARS-CoV-2 Omicron variant. UNPUBLISHED.
[9] https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/1044481/Technical-Briefing-31-Dec-2021-Omicron_severity_update.pdf (Accessed on January 03, 2022).
[10] McMahan K, Giffin V, Tostanoski LH, et al. Reduced Pathogenicity of the SARS-CoV-2 Omicron Variant in Hamsters. UNPUBLISHED.
[11] Diamond M, Halfmann P, Marmura T, et al. The SARS-CoV-2 B.1.1.529 Omicron virus causes attenuated infection and disease in mice and hamsters. UNPUBLISHED.
[12]https://www.fda.gov/medical-devices/coronavirus-covid-19-and-medical-devices/sars-cov-2-viral-mutations-impact-covid-19-tests#omicron(Accessed on December 13, 2021).
[13]https://www.chinacdc.cn/jkzt/crb/zl/szkb_11803/jszl_2275/202111/t20211129_253200.html